位于臺灣海峽與海壇海峽之間。臺灣海峽，位于北太平洋西側臺灣島與大陸之間，是中國最大的海峽。平潭處于臺灣海峽北端西側。海峽呈東北—西南走向，長約440公里，系亞洲大陸板塊的一部分，因第三紀末第四紀初斷裂陷落而形成。地勢大致自西向東傾斜，海底階地、峽谷、淺灘和水道等地貌形態(tài)多樣。
海峽南北端較深，北部一般在100米左右，南部可達400～600米；中南部(東山至澎湖一帶)較淺，約40米左右，有的僅10米。海峽底層蘊藏豐富的石油及砂礦資源。
海峽兩岸都有河川注入，水質肥沃，生物資源豐富，已查明硅藻類有594種、浮游橈足類211種、底棲生物約500種，為魚類繁殖和漁場形成提供優(yōu)越環(huán)境。由于海峽地處太平洋西部北航線的要沖，交通方便，有利于兩岸港口的對外交往。
海壇海峽，在福州市東南，因處大陸與海壇島之間，故名。南北長約40公里，寬3.3～10公里。兩側海岸曲折，多港灣岬角。水深一般5～30米，中部有5米以下淺水區(qū)，可航寬度在300～3000米之間。
海峽沿岸溪河注入有機物和浮游生物，適宜于發(fā)展海上養(yǎng)殖。由于是閩中海上交通要道，兩側均建有港口碼頭。平潭的蘇澳港、竹嶼港、娘宮港以及金井碼頭憑借海峽與福清、長樂、福州及江蘇、浙江、廣東等省溝通。
